Загрузил с флешки Runtu LITE 20.04, linux 5.4
Все диски вижу в файловом менеджере.
Но знаю что в файловом менеджере диски могут не отображаться по нескольким причинам.
Если не путаю, примонтированные в /media отображаются, примонтированые в /mnt нет.
До монтирования тоже бывает не отображаются, если разметка дисков спецефическая, например после dd, если просто убрать таблицу разделов - то флешка не должна отображаться в файловом менеджере, но будет видна в редакторе разделов.
Таким образом делаем вывод. Раз диск не отображается в файловом менеджере до монтирования, но виден в редакторе разделов, то это второй из указанных мной вариантов - какой-то параметр в разметке разделов не нравится файловому менеджеру.
Покажи в Gparted этот диск, сравню со своими, может быть найду отличия в разметке.