В Runtu 10.04 LXDE файловым менеджером, который управляет "Рабочим столом", является PCManFM, в ранних версиях которого нет возможности выбирать значки Рабочего стола, а значок "Мои документы" хардкодный.
Рекомендую установить Runtu LITE, в котором используется Nautilus (10.04), Caja (12.04) или Nemo (14.04). Последние два варианта ещё имеют официальную поддержку соответственно до 2017 и 2019 года, а Рабочий стол настраивается более гибко.