Да ситуация оказалась интересная, и дело, в общем-то, не только и не столько в wine.
Выяснилось, что в этот момент отвалился самбовский ресурс, смонтированный в /mnt/smb/comp1/share . При этом все программы, которыми я пытался зайти в каталог /mnt/smb/comp1 , висли нараз и надолго (минут на пять). Включая даже простой ls /mnt/smb/comp1 . Попытки umount /mnt/smb/comp1/share говорили "ресурс занят" и не помогали. Помогло umount -l /mnt/smb/comp1 . После этого все тормоза, в том числе и в wine, прекратились.
Ранее, на других системах (suse) такого поведения я не замечал. И совершенно непонятно, причём тут wine -- ведь спорный каталог /mnt/smb/comp1/share не открывался ни в одной вайновской программе.
Проверил: такое же поведение получается при отвале ресурса, подключённого по webdav. Так что это довольно глубокий системный глюк.