У Audacious в ассоциациях находтся каталоги (в /usr/share/applications/audacious.desktop), поэтому после установки плеера нужно изменить ассоциации файлов.
В Nautilus/Caja/Nemo нажимаем Переход-Компьютер, нажимаем на значке файловой системы правой кнопкой мыши и в свойствах указываем через какую программу открывать каталоги.
Можно изменить по дургому, открыть в текстовом редакторе /home/user/.local/share/applications/mimeapps.list
В категории [Default Applications] добавить строку inode/directory=nemo.desktop
В категории [Added Associations] добавить строку inode/directory=nemo.desktop;
nemo.desktop - это название кнопки запуска из /usr/share/applications, если у вас другой файловый менеджер, тогда укажите свой.