Системные утилиты - dconf-editor - установить ключ org.gnome.settings-daemon.plugins.keyboard в "false".
Снял галочку Active - значок системной раскладки (после reboot) исчез, да. Но тогда пропадает и русская раскладка.
Причем в "Параметры -> Раскладка клавиатуры" она есть, но переключиться на нее не получается. Ни системными клавишами, ни возможностями gxneur. А в параметрах gxneur русская раскладка вообще пропадает в списке и добавить ее возможности нет. И потом, если бы было так очевидно, не предлагали бы nex-редакторы использовать...
И еще (просто пользуясь случаем))) -
http://forum.runtu.org/index.php/topic,4648.0.html - вот это больше раздражает.