1. Бэкап папки ~/.thunderbird
2. Удаление ~/.thunderbird
Запуск Thunderbird, но при этом все настройки и почта будут сброшены (если конечно она хранится локально на компьютере). Если поковыряться, можно путем копирования папок из резервной копии восстановить почту. Еще можно посмотреть в самом почтовике встроенные средства резервирования/восстановления настроек.