deborphan - маленькая консольная утилита отображающая список библиотек (пакетов), которые не используются никакими другими приложениями (сироты).
Для установки можно использовать Synaptic.
deborphan проста в обращении, будучи запущенной без дополнительных параметров выводит список неиспользуемых пакетов простым списком. Запуск с параметрами позволит отсортировать найденные пакеты по различным параметрам (приоритетам, местоположению и пр...).
Как удалять (или не удалять) обнаруженные пакеты решает каждый сам, можно использовать Synaptic (он так же поможет в очистке кеша пакетов, старых конфигурационных файлов и многого другого), а можно использовать команды:sudo aptitude purge `deborphan`
Или:sudo deborphan | xargs sudo aptitude purge -y
После удаления пакетов, deborphan нужно запустить ещё раз (или два), потому что может обнаружится что после удаления одних пакетов, какие то другие пакеты тоже оказались ненужными.