Команды скорей всего никакие, окромя самого скрипта, с нвидии скаченного. Он и должен модули собрать. Он сам знает как, но ему нужны хидеры, которые если я не путаю, являются частью исходников, нужных как раз для сборки модулей. В вашем случае хидеры должны браться не из отдельного пакета, а из тех самых исходников, из которых ядро собрано. Скрипт нвидии не находит хидеров в том месте, где они должны по его мнению быть. И просит указать путь к ним. Прям в командной строке запуска скрипта, после специального ключа --kernel-sorce-path. Наверное как-то так.