Я уже писал ранее
запустить в терминале thunar или sudo thunar .
А потом попробовать его просто переустановить. Еще возможно он слетел с автозагрузки (xdg...).
Нужно найти и проверить файл автозагрузки Thunar. Нужно копать в этом направлении. Возможно он поврежден или удален. Тут разные варианты, но если не хватает знаний, лучше просто сохранить нужные файлы на другой диск и переустановить систему. Это займет пол часа с настройками. Обновления тоже могли исправить файлы, но вы этого не делали. Я бы начал с проверки
xdg-mime query default inode/directory
Посмотрел, где лежит этот файл запуска thunar и его содержимое. Но лучше не морочить голову, а просто переустановить систему. .