Технологии развиваются, поэтому для корректной обработки файлов полученных из внешнего мира желательно использовать актуальные версии программ, например сейчас стабильными являются системы с цифрой 14.04 в названии.
Системы Runtu имеют обновление программ, но у них не реализован переход с одной версии Runtu на другую. Поэтому переход между версиями осуществляется стиранием старой системы и установкой новой системы, с сохранением прочих файлов на отдельном разделе.
На счет сохранения домашнего каталога - не всегда подходит старый к новому, нужно ковыряться. Чтобы не ковыряться просто держу home вместе с корневым каталогом на одном разделе жесткого диска (50 гигабайт), а для прочих файлов (фильмов, документов, музыки) держу отдельный раздел жесткого диска.
Пояснение про системный раздел в 50 гигабайт: 15 под систему и программы, остальное под разную текучку, перед переездом на новую версию системы ценные файлы выгружаю из системного раздела.