В последней версии Runtu Lite 12.04 сглаживание настраивается редактированием файла
~/.fonts.conf
после перезапуска программы применят настройку, поэтому лучше сделать выход из системы и вход
Программе lxappearance для применения настроек нужна lxsession, то есть чтобы в ней заработала настройка сглаживания шрифтов нужно переделывать систему.