В Ubuntu программы разделены по типам лицензий на 4 репозитория:
Main – свободное ПО, официально поддерживаемое компанией Canonical.
Restricted – проприетарное ПО (в основном — драйверы устройств), официально поддерживаемое компанией Canonical.
Universe – свободное ПО, официально не поддерживаемое компанией Canonical (но поддерживаемое сообществом пользователей).
Multiverse – проприетарное ПО, не поддерживаемое компанией Canonical.
В коммерческих организациях можно устанавливать программы из Main, Restricted, Universe.
В Multiverse есть программы с лицензией shareware - бесплатные для домашнего использования, но платные для использованя в фирмах.
Откываем Synaptic, на боковой панели нажимаем кнопку происхождение, повыше выбираем строку с названием Multiverse и смотрим что установлено в системе, затем смотрим лицензии на эти программы.
Лицензию к программе можно прочесть здесь
http://packages.ubuntu.com/, или после установки программы здесь /usr/share/doc, или на официальном сайте программы.
Вывод: Если захотите установить в фирме какую-либо программу, обращайте внимание на лицензию.
Дома проверять никто не будет, всё на вашей совести.
С проверяющими проблем быть не должно, если лицензии соблюдаете. А от проверяющих дураков никто не застрахован - таким придется с документами или без доказывать свою невиновность всеми доступными методами.