Вторым важным отличием Linux Mint 12 является обеспечение из коробки возможности параллельной установки окружения MATE Desktop Environment, в рамках которого развивается форк GNOME 2.32. Одновременная установка оригинального GNOME 2.32 и GNOME 3 невозможна из-за пересечения некоторых имён файлов, но в проекте MATE вызывающие конфликт проблемы решены, поэтому данную оболочку можно установить одновременно с другими версиями GNOME. Оболочка MATE входит в базовый LiveDVD, пользователи LiveCD могут инсталлировать её установив метапакет "mint-meta-mate". Окружение MATE не будет выделяться от прошлых выпусков дистрибутива, так как в него интегрированы используемые ранее компоненты Linux Mint, такие как mintDesktop и mintMenu. Отмечается, что стабильность MATE пока оставляет желать лучшего, но ситуация скоро изменится, так как к развитию MATE, которым ранее занимались несколько энтузиастов из проекта Arch Linux, присоединились разработчики дистрибутива Linux Mint.