Начиная с версии 4 проведена реструктуризация файловой системы (данные распределены по каталогам /AppFiles, /System, /Temporary, /Users, /Volumes, стандартные каталоги (/usr, /var и т.п.) присутствуют, но скрыты от пользователя)
Этот функционал реализуется патчем ядра проекта
GoboLinux. Целью данного проекта является изменение отображения файловой структуры пользователю. Для совместимости с другими дистрибутивами и программами создаются специальные ссылки, формирующие файловую структуру корневой системы. Этот патч использовался дистрибутиве LinuxXP.
На мой взгляд, крайне неудачное решение, поскольку не позволяет понять стандартную структуру Linux-дистрибутива и затруднит применение существующих руководств.
Все-таки POSIX стандарты наименования директорий были созданы очень давно. И теперь мы имеем то, что называется "исторически сложилось". Наименование директорий для хранения системы, программ, данных программ и данных пользователей в MacOS и в Windows7 реализованы более понятно, чем в старом POSIX.
Стандартом, определяющим набор и место размещения в файловой системе штатных утилит, системных файлов и директорий, неизменных для всех совместимых Linux-дистрибутивов и Unix-подобных систем, является FHS (Filesystem Hierarchy Standard). Он постоянно развивается и дорабатывается с учётом современных тенденций развития, поэтому говорить о его "устаревании" неверно.
Я конечно понимаю, что можно ко всему привыкнуть, но если сравнивать, то, с позиции дилетанта, складывается впечатление, что Linux не развивается и застыл в 50х-60х годах.
Лично меня удручает то, что разработчики Windows начинают понимать преимущества "исторически сложившихся" понятий "Репозиторий", "Централизованное обновление", "Разграничение прав пользователей" и других основополагающих технологий, используемых в *nix-системах и постепенно реализуют эти возможности в своих системах, в то время как в стане Linux начинается "разброд и шатание", связанное с введением ложных ценностей, завуалированных под "Удобство пользователя" и непониманием философии GNU.