Микрофон моно настраивается следующим образом в alsa-mixer он регулируется левым и правым каналом, но реально он монофонический, т.е. один движок надо выставить в ноль, а вторым регулировать чувствительность микрофона. Из-за таких сложностей я полностью отказался от использования этого гнезда для внешнего микрофона. Во-первых, очень хорошо работает встроенный, во-вторых, через USB-bluetouth можно подцепить телефонную беспроводную гарнитуру, что мне показалось гораздо удобнее всего остального. И о том, как я подключал Jabra-гарнитуру писал на этом форуме достаточно подробно, а как подключить стереогарнитуру писала Vita.