Возможно в новых версиях проблема уже решена.
Возможно...
При чем у меня разрешение слетает как-то не правильно.
Разрешение монитора остается 800 на 600, а рабочего стола сбрасывается на 1024 на 768.
С этим разобрался, в xorg.conf в секции screen параметр virtual вручную прописывать надо.
Вобщем редактирование xorg.conf помогло.